ב-Back to the Roots, שחקנים יצטרכו למצוא ולרפא את כל השורשים הפגועים של העץ בביומוטנט. זה לא מסע קשה במיוחד, שכן כל שלב יסומן על ידי נקודת ציון שמראה להם מה לעשות. איפה שזה עלול להסתבך קצת זה להשיג את הנונו, יצור מוזר שהם צריכים להביא לשורש.
ניתן למצוא את הנונוס בצמחים מיוחדים הגדלים ברחבי העולם. לרוב ישמרו עליהם אויבים מרובים, כך שהשחקנים יצטרכו להילחם אליהם או להתגנב פנימה ולהשיג את הנונו בצורה חמקנית יותר.
מסביב לעץ יצמחו כמה פרחים ורודים. כדי להשיג את הנונו, השחקן יצטרך להכות את הפרחים עם הנשק שלו ואז לגרוף את הנונו ברשת שקיבלו קודם לכן במשחק.
ברגע שיש להם את ה-NoNo, הם יכולים פשוט להביא אותו לנקודת הציון, לקיים אינטראקציה עם השורש, והם אמורים להיות מוכנים ללכת. יהיו עוד צמחי NoNo מוסתרים מסביב למפה, אז הקפידו לפקוח עין אחריהם, אבל תמיד צריך להפנות אתכם לצמח חדש כחלק הבא של המשימה אם אין לכם כאלה במלאי.
