אתה תתקל בכמה קרבות בוס ב- Metroid Dread, אחד מהם תתמודד מספר פעמים. יחידות מרכזיות הן אויב שחוזר על עצמו במשחק ואלה שתצטרכו להביס שוב ושוב כדי להתקדם. הבסתם מתגמלת את סמוס עם תותח האומגה, הדרך היחידה להביס אתאמי.
יחידות מרכזיות הן יצורי מוח צפים של AI עם עין מרכזית. ניתן למצוא אותם באזורי היחידה המרכזית המסומנים במפה. תצטרכו להתחמק מ-EMMI בדרך לחדר שבו הם נמצאים. זה יכול להיות אתגר קשה מכיוון שהרובוטים עוקבים אחר סמוס דרך המיקומים האישיים שלהם, אבל ברגע שאתה מביס יחידה מרכזית, הנקמה מרגישה כל כך טוב.
לחימה ביחידה מרכזית מסתכמת בהימנעות מטיל בזמן ירי מיקוד על המכונה המרחפת. החדרים מרובעים וקלים לתמרון, כך שהם לא כל כך מאתגרים, לפחות כאשר אתה משווה אותם לבוסים אחרים. היחידה המרכזית תישאר מרחפת במרכז החדר ואין לה התקפה שתפגע בסמוס. עם זאת, שני תותחים מופיעים על הקירות ויורים לייזרים לעבר סמוס במהלך הקרב. קפוץ מעל או החלק מתחת ללייזר כדי להימנע מכך. יחד עם הלייזרים יש שני דיסקים כתומים שעפים גם על פני החדר. ניתן להשמיד את הדיסקים עם קרן המטען או טילים ולהפיל אנרגיה או טילים כשהם מובסים.

בזמן שאתה נמנע מהקליעים, המשך לירות טילים, קרן המטען או תותח הקרן לעבר היחידה המרכזית עד שהיא תאבד את השריון המגן שלה. לאחר מכן, הלייזרים והדיסקים מופיעים מהר יותר. שים לב לשניהם כשאתה ממשיך לירות לעבר הבוס. זה יתפורר בצורה של רגעים וייפול ארצה ויגרום לסצנה שבה סמוס מקבל את תותח האומגה.